Письмо Департамента налоговой и таможенно-тарифной политики Минфина РФ от 5 августа 2010 г. N 03-11-06/2/123 О налогообложении субсидий, получаемых из бюджета на компенсацию произведенных затрат
 
В рамках УСН не учитываются доходы в виде средств целевого финансирования.
К ним относятся, в частности, ассигнования для бюджетных учреждений и субсидии для автономных.
При налогообложении прибыли также не учитываются целевые поступления. Речь идет о тех, которые переданы безвозмездно и направляются на содержание некоммерческих организаций.
Субсидии для иных организаций (кроме автономных учреждений), за счет которых возмещаются затраты или недополученные доходы в связи с реализацией товаров (выполнением работ, оказанием услуг), признаются доходом в рамках общей системы налогообложения и УСН.
Субсидии на возмещение недополученных доходов в связи с реализацией товаров, выполнением работ или оказанием услуг по регулируемым ценам в рамках деятельности, в отношении которой применяется ЕНВД, облагаться налогами в рамках иных режимов не должны. Средства, выделяемые на иные цели, включаются в состав внереализационных доходов.
 
 
http://www.garant.ru/products/ipo/prime/doc/12077893/?prime